Svensken räddade första gamet trots två dubbelfel i första set, men hade sedan ingen chans mot Federer, som bröt direkt i andra.
Med två serveess räddade Robin ett game i andra set.
"Jag är förvånad" -Jag är faktiskt förvånad med tanke på hur duktig Robin är. Såna här siffror är ovanliga, i synnerhet bland de fem bästa, säger Roger Federer efter matchen.
Federer har nu 14-1 i matcher mot Söderling och förlusten är svenskens största hittills mot Federer.
Dessutom är det Söderlings tyngsta förlust sedan april 2009 då svensken bara fick med sig ett game mot Rafael Nadal i Rom ATP.
-Det funkade bra för mig men för honom gick det bara sämre och sämre. Jag varierade slagen, spelade rörligt och höll hög standard hela vägen. Det räckte, säger Federer.
"Robin rörde sig för dåligt" Robin Söderling rörde sig för dåligt i dag, menar SVT:s tennisexpert Janne Gunnarsson.
-Söderling måste vara igång mycket bättre i fotarbetet. Det stora problemet tror jag är att han rörde sig för dåligt och då kommer misstagen.
-Ska man besegrea eller spela jämnt med Roger Federer måste man röra sig mycket bättre än vad Robin gjorde i dag.
Matchen var ett genrep inför Stockholm Open, som börjar på måndag och som SVT sänder.
-Söderling måste spela bra mycket bättre än i dag för att nå finalen, men jag tror att han kommer att vara oerhört mentalt laddad för en final i Stockholm Open, säger Gunnarsson.
-Jag tror att det är stor möjlighet att dessa två herrar möts på söndag (nästa vecka).
I semifinalen i Shanghai ställs Roger Federer mot Novak Djokovic.
SVT Play
