Den svenske världsfyran är ännu utan setförlust i årets första Grand Slam-turnering i Melbourne.
-Fysiskt känner jag mig väldigt bra. Jag har inte tillbringat alltför många timmar på banan och jag är redan i fjärde omgången, vilket är bra och en stor fördel för mig, sa han till nyhetsbyrån AFP.
Den 241-rankade tjecken som kvalat in i turneringen kunde aldrig pressa Söderling, men han lyckades bryta svenskens serve för första gången i turneringen.
Det var i matchens sjätte game som Hernych bröt Söderling, men det hjälpte föga när han själv tappade sin serve två gånger och förlorade setet 6-4.
Det andra setet vann svensken sen med 6-1 på bara 22 minuter. När Söderling sen bröt Hernych igen vid ledning 5-4 i det tredje setet var saken klar.
-Jag spelade ganska bra. Jag vet att jag kan bättre men som helhet var det en bra insats, tyckte Söderling.
Härnäst väntar överraskningen Oleksander Dolgopolov från Ukraina, rankad som 56:a i världen. Dolgopolov slog i tredje omgången ut fransmannen Jo-Wilfred Tsonga, seedad som nummer 13, i fem set.
SVT Play
