Avtalet omfattar vattendrag i Nissans källflöden i länets västra delar.
Enligt länsstyrelsen har området höga naturvärden och både flodpärlsmussla och öringstammar.
– Detta är bland det största som hittills gjorts för skydd av vatten i länet, säger Therese Helgesson, naturvårdshandläggare på länsstyrelsen, i ett pressmeddelande.
Syftet med avtalet är att skydda den biologiska mångfalden i området.