Larmet om branden kom strax efter halv ett natten mot onsdagen. Branden startade på ett 200 meter långt transportband vid ett pelletslager och spred sig sedan till flera andra industribyggnader.
Som mest bekämpade ett 50-tal brandmän från tio olika stationer branden.
– Nu har vi läget under kontroll, sa stabsbrandmästare Lars Anderberg på onsdagsmorgonen.
Men branden i det över 20.000 kvadratmeter stora pelletslagret fortsatte och det räknar man med att det kommer att fortsätta att göra i ytterligare ett dygn.
Det har inte varit någon fara för allmänheten eftersom vinden legat rätt håll.
Ventrafiken går som vanligt men Västra Kajgatan är avstängd.