Några raketer förstördes i luften av Israels antimissillsystem, uppger den israeliska militären. Enligt en anställd vid stadshuset i Eilat förstördes tre raketer och en slog ner utanför staden.
Strider mellan egyptiska styrkor och sunniextremister, som är lojala med terrorrörelsen Islamiska staten (IS), rasar på Sinaihalvön.
Bara timmar efter raketattacken mot Eilat dödades två palestinier i Gazaremsan, och fem har skadats, när en tunnel vid den egyptiska gränsen rasade in efter en israelisk flygattack, uppger Gazas hälsodepartement.
En talesperson för den israeliska militären sade sig dock inte ha någon kännedom om någon attack.