Enligt chefsåklagaren Chaibou Samna inleddes rättgångarna mot personer som åtalats den 2 mars för misstänkt terrorkoppling.
De som ställs inför rätta är från flera länder, däribland Niger, Mali och Nigeria. Boko Haram har sitt starkaste fäste i Nigeria. En del av de misstänkta greps när de deltog i strider i södra Niger.
LÄS MER: Presidenten i Nigeria: ”Vi har krossat Boko Haram”
Enligt Samna kommer rättegångarna att pågå i flera månader och rendera i straff på upp till tio års fängelse.
– Det har redan varit en del fällande domar, men ett stort antal personer har frisläppts i brist på bevis, säger han.
Enligt en säkerhetskälla har omkring 1 200 personer som misstänks för kopplingar till terrorrörelsen varit frihetsberövade i väntan på rättegång sedan 2015.