Khameneis uttalande säger emot landets president Hassan Rouhani som nyligen sagt att landet är redo att hålla samtal med USA om lösningar på inbördeskriget i Syrien.
Samtidigt säger Hillary Clinton att hon skulle straffa Iran om det kränker det kärntekniska avtalet om hon var president och att USA kommer att ingripa militärt om Iran skaffar kärnvapen.
Enligt FN:s atomenergiorgan IAEA finns det oklarheter i informationen det fått från Iran om landets kärnenergiprogram. IAEA vill därför ha ett klargörande från Teheran, rapporterar AFP.