Frankrike vann med 1-0 sedan den svenska förbundskaptenen Calle Barrling valt att vaska om en del i startelvan och ge nya spelare chansen.
Målet kom redan i den sjätte minuten, då mittbacken Noémie Carage hittade rätt.
I och med förlusten slutar Sverige, som tidigare i turneringen besegrat hemmanationen Israel och Danmark, på andra plats i gruppen. I fredagens semifinal väntar nu Tyskland för Sverige, som vann turneringens andra grupp.
Semifinalplatsen i EM innebär även att Sverige har säkrat en plats i nästa års U20-VM, som spelas i Papua Nya Guinea.