Mayweather missade nyligen en tidsfrist inom vilken han var tvungen att betala 200.000 dollar i påföljdsavgift för matchen mot Pacquiao i maj.
Dessutom var stjärnan tvungen att avsäga sig titeln i lätt mellanvikt som han har sedan tidigare, eftersom man inte får har flera olika titlar i samma viktklass.
Mayweathers tidfrist gick ut i fredags.
Kan överklaga
”WBOs kommitté har inget annat alternativ än att sluta erkänna mr. Floyd Mayweather Jr som WBO-världsmästare i weltervikt för att inte ha följt WBO-reglerna för världsmästar-tävlingar”, säger WBO i ett pressmeddelande.
Mayweather, som tjänade 200 miljoner dollar för fajten mot Manny Pacquiao, och som genererade rekord i pay-per-view intäkter i USA på 400 miljoner, har två veckor på sig att lämna in ett överklagande.