Den ena serien kommer att utgå från huvudberättelsen medan den andra kommer att fokusera på chokladfabrikens oompa-loompier, de kortväxta arbetarna som fabrikens ägare Willy Wonka säger sig ha rekryterat i djungeln.
Utöver rollen som regissör kommer Taika Waititi att skriva manus och verka som exekutiv producent.
Netflix har även planer på att göra serier av ytterligare 15 Roald Dahl-böcker.