Containrarna innehöll verktyg och vid stölden på Sjögatan uppskattas värdet på det stulna till drygt en miljon kronor.
När det gäller vad som stulits ur containrarna vid Sjötullsgatan finns det ännu ingen uppskattning kring vilka värden som försvunnit.
Containrarna är avspärrade och under dagen ska en polisen genomföra en teknisk undersökning.
Likande upptäckt i Sundsvall
Samtidigt har polisen i Sundsvall rapporterat om liknande stölder, som också upptäckt på måndagsmorgonen. Där har man upptäckt att flera containrar på två företag blivit uppbrutna. Där har polisen under förmiddagen genomfört brottsplatsundersökningar.
MISSA INTE: Så får du lokala nyheter i SVT:s app
Det är inte klarlagt om stölderna i Hudiksvall kan kopplas samman med det som skett i Sundsvall.