Polarforskningssekretariatet bedriver inte någon egen forskning utan arbetar för att underlätta för svenska polarforskare att bedriva sin verksamhet.

Har som huvudsaklig uppgift att organisera och stödja forskningsexpeditioner till polarområdena och ansvara för forskningsinfrastruktur. Isbrytaren Oden, forskningsstationerna Svea och Vasa på Antarktis och forskningsstationen i Abisko är infrastruktur som myndigheten förfogar över.

Idag finns ett drygt trettiotal anställda på myndigheten; ett tiotal på isbrytaren Oden, ett tiotal på forskningsstationen i Abisko och lika många på kontoret i Stockholm. Och det är de administrativa tjänsterna inom ekonomi, hr, ledning och kommunikation som kommer att flyttas till Luleå.

Myndigheten har även till uppgift att aktivt arbeta för att förbättra miljöskyddet i polarområdena.