Förundersökningen läggs ned eftersom brott inte kan styrkas.
Enligt Skolverket hade skolorna kvitterat ut statliga bidrag på felaktiga grunder, och gjorde därför en polisanmälan.
Men kammaråklagare Yngve Rydberg skriver i beslutet att han inte anser sig kunna bevisa att någon företrädare för internatskolorna uppsåtligen lämnat osanna och vilseledande uppgifter till Skolverket.