Enligt tingsrätten var motivet till gärningarna att kränka ungdomarnas sexuella läggning och könsöverskridande identiteter.
Händelserna inträffade inne i en butik på stationen i Södertälje centrum och på ett pendeltåg. 16-åringen ska i närvaro av sina kompisar kallat ungdomarna för skällsord och hotat med att slå en av dem med en flaska.
På pendeltåget ska han sedan ha slagit en snökocka i huvudet på en av ungdomarna och stuckit honom i handen med en nål från en pin med pridemotiv.
Känner sig otrygga i Södertälje
Flera av ungdomarna som är målsägande i fallet säger att de efter händelsen känner sig otrygga i Södertälje.
I bevismaterialet fanns bland annat övervakningsfilmer från pendeltåget och butiken. 16-åringen har förnekat alla gärningarna.