Branden ska ha startat i maskinrummet, och enligt polisens presstalesperson handlar det om att olja och värme på något sätt kommit i kontakt.
På båten befann sig omkring 80 personer, ingen uppges vara skadad.
Aftonbladet skriver kl 16.24 att branden är släckt och att räddningstjänsten håller på att avverka sin insats.
Båten, som tillhör Waxholmsbolaget, ska besiktigas av trafikförvaltningen på Region Stockholm och ligger förtöjd i väntan på kontroll.
– Branden skedde när fartyget låg förtöjt för lastning. De resande har kunnat ta nästa tur, säger Carl-Henrik Elfsberg, pressjour på trafikförvaltningen.
Vet du mer? Har du bilder? Kontakta SVT Nyheter Stockholm på 08-7847750 eller mejla stockholm@svt.se