Polisen larmades till vandrarhemmet i centrala Stockholm runt midnatt.
– En man med kniv var hotfull mot boende och gäster på hostelet, säger Per Fahlström, presstalesperson hos polisen i region Stockholm.
– I samband med ingripandet uppstod en hotfull situation, så polisen avlossade sitt tjänstevapen. Mannen blev då skottskadad och han har förts med ambulans till sjukhus. Han var vaken och talbar då han fördes iväg, säger Per Fahlström.
Det finns inga uppgifter om att någon annan har skadats fysiskt vid händelsen.
– Vi har spärrat av kring platsen där det hände och kommer göra en teknisk undersökning, säger Per Fahlström.
En förundersökning om grovt olaga hot har inletts.
Händelsen anmäls också till särskilda utredningar, vilket är rutin då en polis avslossar tjänstevapen och en person skadas.