Skottlossningen inträffade på Fruängstorget i södra Stockholm. De två tonåringarna fördes till sjukhus där de vårdats för sina skador sedan dess. Under onsdagen avled den ena pojken till följd av sina skador, uppger åklagaren i ett pressmeddelande.
För den andra pojken bedöms läget vara stabilt.
Tonåring häktas
En person som varit anhållen för brottet sedan natten mot måndag häktades på torsdagsmorgonen efter beslut i Södertörns tingsrätt.
– Jag har nu begärt att den anhållna personen, även det en pojke i tonårsåldern, ska häktas på sannolika skäl misstänkt för mord och försök till mord, sa senior åklagare Ingrid Viklund i ett pressmeddelande.
Pojken förnekar brott och motsätter sig häktningen.
Under fredagen häktades ytterligare två personer för medhjälp till mord och medhjälp till försök till mord och ytterligare en person häktades för samma brott under lördagen, uppger Åklagarmyndigheten.
De tre personerna, som anhölls tidigare i veckan, är samtliga under 20 år.