Länsstyrelsen anser att plan- och byggnadsnämnden gjort ett formellt fel eftersom de tog ett beslut innan yttrandetiden gått ut. Det innebär att beslutet ska upphävas och ärendet skickas tillbaka till kommunen för ny handläggning.
Det var i december 2014 som plan- och byggnadsnämnden beviljade Uppsala Airport AB bygglov för bygge av en terminal, anläggning av en ny parkering och en platta för flygplan. Beslutet överklagades av 35 personer. Bland annat hänvisade de till utsläpp och buller samt att handläggningen skett på ett felaktigt sätt.