Uppgifterna om antalet döda gavs i ett tal av president Muhammadu Buhari under fredagen. I det fördömde han demonstrationerna, som enligt Buhari kännetecknats av huliganism och våld.
Det är oklart om de tolv människor som enligt Amnesty international sköts ihjäl i Lagos tidigare i veckan finns med bland dem 51 döda. Samtidigt har enligt presidenten elva poliser och sju soldater dött.
Protesterna inleddes den 7 oktober med krav från demonstranter om att den ökända specialenheten inom den nationella polisen, Sars, skulle upplösas. Enheten har bland annat anklagats för ogrundade gripanden och övervåld. Kraven hörsammades av president Buhari, som den 11 oktober valde att stänga ned enheten.
Men demonstrationerna har efter det övergått till att omfatta bredare krav på polisreformer och ett slut på korruption.
Oroligheterna beskrivs som de mest omfattande i Afrikas mest folkrika land på över två decennier.