Den misstänkte 28-åringen medverkade via videolänk från häktet.
I rättssalen fanns cirka 50 anhöriga till dem som miste livet i moskédådet den 15 mars.
Den misstänkte mannen, som är australisk medborgare, kommer enligt polisen att ställas till svars för 50 mord och 39 mordförsök.