Flickan ska ha angripits vid 10.30- tiden på torsdagen av en annan elev, en pojke. Enligt tyska medieuppgifter hade de två någon form av relation.
Den misstänkte mördaren flydde efter dådet, men kunde gripas några timmar senare efter en polisjakt.
Skolan har evakuerats, men polisen utgår från att det inte finns någon risk för övriga elever.