Minst elva personer har omkommit och 19 saknas efter att omfattande säsongsregn orsakat översvämningar i landets sydliga och östliga delar, enligt myndighetssiffror.
– Vi har haft översvämningar förut, men det här är de värsta regnoväder och de högsta vattennivåer vi någonsin haft, säger Henry Oaminal, guvernör i provinsen Misamis Occidental, i lokal radio.
Enligt kustbevakningen var två av de omkomna besättningsmän på en fiskebåt som under juldagen kapsejsade i samband med hårda vindar utanför ön Leyte. De flesta av de saknade uppges också vara småskaliga fiskare.
Av de totalt 45 700 personer som evakuerades från sina hem kom 33 000 från staden Gingoog.