Riksåklagare Paulo Gonet Branco har väckt åtal mot Bolsonaro och 33 andra personer för flera brott som hotat landets demokrati. Åtalet baseras på en detaljerad rapport från Brasiliens federala polis från november förra året.
Enligt åklagare började den tidigare presidentens komplott redan 2021 med försök att underminera förtroendet för elektroniska röstningsmaskiner. 2022 ska Bolsonaro ha träffat diplomater för att sprida misstankar om valfusk och förbereda omvärlden på att ifrågasätta resultatet.
Han ska även ha godkänt en kupp-plan, som inkluderade mord på den nyvalde presidenten Lula da Silva och en domare i högsta domstolen, Alexandre de Moraes, som varit en kritiker av Bolsonaro.
Kan bli långt fängelsestraff om han fälls
Fallet kommer nu att tas upp av Brasiliens högsta domstol, som ska besluta om Bolsonaro ska häktas och ställas inför rätta. Om han fälls kan han dömas till mellan 12 och 40 års fängelse, även om politiska analytiker spår att straffet kan bli kortare.
I en intervju förra månaden förnekade Bolsonaro anklagelserna om en kupp-plan och hävdade att han endast ifrågasatt ett valsystem som han ansåg vara felaktigt.
Om Bolsonaro döms till fängelsestraff blir han landets tredje president på åtta år som fängslas.