Kvinnan är i 70-årsåldern. Hon blev skjuten i bröstet vid ett överfall på måndagen.
Kvinnan blev angripen när hon var på väg hem från arbetet. Hon träffades av en kula i bröstkorgen. Hon har bott i landet i 35 år.
Kvinnan är enligt UD hemmahörande i mellersta Sverige.
– Hennes tillstånd har förbättrats efter behandling, säger Ali Usman, läkare på det sjukhus där hon behandlas, till nyhetsbyrån AFP.
– Hon var hemma på lunch och var utanför grinden när en ensam motorcyklist åkte upp och sköt henne bakifrån, säger ordföranden i pingstförsamlingen som kvinnan arbetar för.
Det verkar inte som ett rån utan en riktad attack?
– Ja, tyvärr så verkar det så, svarar han.
Jobbar med föräldrarlösa flickor
Församlingen är den som skickat ut kvinnan till Pakistan. Där driver församlingen, i samarbete med sin amerikanska partner, en internatskola för 65 föräldralösa flickor som kvinnan arbetade vid i staden Lahore.
Församlingen samlades på måndagen till ett krismöte för att diskutera läget. En svensk familj med två vuxna och fyra barn är också utsänd till Pakistan av församlingen, men i Islamabad.
Vilka angriparna är vet man inte.
– Vi har information om att en svensk kvinna är skottskadad i Lahore. Hon är allvarligt skadad och befinner sig på sjukhus, säger Teo Zetterman på svenska utrikesdepartementets (UD) presstjänst till SVT.
Enligt UD har personal från svenska konsulatet i Lahore har besökt sjukhuset och håller kontakt med läkarna. UD fick uppgifterna om den skjutna svensken i dag vid 14-tiden på eftermiddagen.
– Vi har kontakt med hennes anhöriga och läkarna på sjukhuset, säger Zetterman.