Enligt lagförslaget förbjuds aborter helt i delstaten. Undantag görs vid våldtäkt och incest före vecka 10, om moderns liv är i fara och om fostret har en dödlig sjukdom, skriver nyhetsbyrån AP.
Aborter kommer bara att få genomföras på sjukhusen, vilket innebär att alla abortkliniker i delstaten förlorar sina tillstånd.
Läkare som utför illegala aborter eller som inte lämnar rätt dokumentation förlorar automatiskt sin legitimation.
Även det är en skärpning, tidigare slog lagen fast att läkare riskerade att förlora sin legitimation.
Röstsiffrorna var tydliga i den republikanskt styrda kongressen: 28-19 i senaten, 62-38 i representanthuset. Åtta republikaner röstade mot lagförslaget.
-Personligen är jag mest stolt över varenda Indianabo som modigt steg fram för att dela med sig av sina åsikter i en debatt som sannolikt inte kommer att upphöra på lång tid, säger delstatens republikanske guvernör Eric Holcomb i ett uttalande.
Härom dagen avvisade väljarna i Kansas med bred majoritet ett förslag om skärpt abortlag. Folkomröstningen var den första efter högsta domstolens beslut.
Den nya lagen träder i kraft den 15 september.