Uttalandet görs dagen efter att delegationer från Finland, Sverige och Turkiet haft nya samtal vid Natohögkvarteret i Bryssel under måndagen.
Niinistö säger, enligt Yle som hänvisar till den finska nyhetsbyrån STT, att även om inte Turkiet har backat från sin ståndpunkt att blockera de båda ländernas medlemskap i försvarsalliansen är det ändå ett ”framsteg” att länderna nu förhandlar med varandra.
Presidenten kommenterade även Turkiets krav, där han menar att Finland redan har samma inställning till terrorism som resten av medlemsländerna.
– Vi har lite svårigheter att vara bättre än genomsnittet i Nato, säger han vidare.
Sauli Niinistö vill i nuläget inte förekomma tidsplanen för ansökningsprocessen. På fråga om landet kan vara medlemmar av Nato till september, svarar han:
– Det kan vara möjligt, men det är även möjligt att vi inte är medlemmar då, säger han.
Mötet i Madrid inleds den 28 juni och de ursprungliga förhoppningarna var att Finlands och Sveriges ansökningsprocesser skull bli klara då.