54-åriga Szydlo är en av Polens mest populära politiker. Hon har suttit på posten i två år. Morawiecki hämtades från bankvärlden när han blev minister 2015.
Beslutet var väntat sedan regeringspartiet Lag och Rättvisa redan under torsdagen beslöt att ersätta Szydlo med Morawiecki, inför flera val som väntar de kommande tre åren.