”Han agerade osportsligt vid flera tillfällen mot domarrepresentanter”, skriver Fifa i ett uttalande enligt nyhetsbyrån AP.
Santos visades upp på läktaren under kvartsfinalen mot Costa Rica där Grekland åkte ur turneringen efter straffar.
Portugisens kontrakt med Grekland gick ut efter mästerskapet. Straffet gäller om Santos kommer att träna ett landslag i framtiden. Han har chans att överklaga beslutet.