Kvällens första mål kom i nionde minuten, ett snöpligt självmål av Mexikos Erick Aguirre.
Nigerias främste målskytt, Kelechi Iheanacho, gjorde sedan 2-0 innan lagkapten Musa Muhammed fastsällde slutresultatet 3-0.
Mexiko förlorade mot Nigeria även i premiären för två veckor sedan – då med hela 1-6.
Iheanacho hade chans att utmana svenske stjärnan Valmir Berisha om skytteligantiteln – men ett mål i matchen räckte inte för att stjäla tronen från svensken. Berisha gjorde sju mål totalt under turneringen – tre av dem i bronsmatchen mot Argentina – Iheanacho stannar på sex.