– Den stora utmaningen kommer att ske i alperna men efter tre dagar i Pyreneerna är vi så klart trötta, säger Froome, helnöjd med hjälpryttarna, där Geraint Thomas är femma i totalen.
Nairo Quintana, Alejandro Valverde och Alberto Contador försökte rycka ett par gånger men blev infångad av Froome eller någon av hans hjälpryttare i Sky.
Joaquim Rodriguez släpptes i väg och kunde utnyttja tillfället och vinna sin andra etapp efter solokörning de sista åtta kilometrarna rätt uppför i regnet.
– Det var viktigt för mig att få vinna på touren. Det var länge sedan jag vann en etapp, 2009, och nu har jag två stycken, säger den glade spanjoren.
Dansken Jakob Fuglsang var tvåa dryga minuten efter mål. Astana satsar nu på dansken som kapten och låter förra årets Tour-vinnare, Vincenzo Nibali, ta på sig rollen som hjälpryttare.
Vid starten var det tryckande värme med 36 grader i denna på många sätt omväxlande etapp.