Ledningsmålet kom tidigt då Akinkunmi Amoo, 19, bjöd på ett snyggt långskott.
2-0 kom strax innan paus efter en läcker frisparksvariant. Amoo spelade snyggt fram Aziz Ouattara Mohammed som satte dit bollen.
I början av andra var Vladimir Rodic väldigt nära och i 70:e minuten small det. Från liten vinkel lyfte han bollen över målvakten och bröt därmed en 33 matcher lång måltorka.
”Extremt besvikna”
I och med segern lever hoppet om en europaplats för Hammarby, medan IFK Göteborg fortsätter att ha det tungt. Senast förlorade laget med 3-1 borta mot AIK.
– Vi är extremt besvikna över insatsen. Vi spelar mot två bra lag i Stockholm och släpper in sex och gör ett. Vi är alldeles för skeva och släpper in för många mål, säger Blåvitt-tränaren Mikael Stahre.
– Så klart att vi är besvikna. Vi hade hoppats på mer. Det är för dåligt, säger Tobias Sana.
IFK Göteborgs Oscar Wendt fanns med i startelvan, men skadade sig på uppvärmningen och ersattes av brasilianaren Bernardo Vilar.