I mitten av första halvlek pangade Sanne Troelsgaard in 1-0 via ribban efter att bollen studsat runt i straffområdet efter en hörna.
– Det är skönt att kunna göra mål ändå, säger danskan efter att ha fått spela ytterback enligt Aftonbladet.
När Loreta Kullashi fick spela i anfallet flyttades Troelsgaard ner i backposition från den normala i anfallet.
I mitten av andra halvlek satte Jelena Jankovic 2-0 från straffpunkten efter att Mimmi Larsson blivit bryskt fälld av Hammarbys målvakt Anna Tamminen.
Tränaren irriterad efter insläppt reducering
På tilläggstid reducerade Hammarby till 2-1 efter att det inte rensats ordentligt i försvaret, något som retade Rosengårds tränare.
– Vi ska inte bjuda på det alls, så jag är missnöjd, säger Renée Slegers till Sydsvenskan.
Rosengård kunde avgjort matchen redan i första halvlek men satte inte de lägen som uppstod.
– Jag tycker vi kan döda matchen mycket tidigare och göra både 3-0 och 4-0 så det slipper bli så här onödigt spännande, säger Caroline Seger.
I onsdag spelade blev Rosengård utslaget av tyska Hoffenhiem med sammanlagt 3-6 (0-3,3-3)
OBOS Damallsvenskan
Hammarby IF
1 - 2
FC Rosengård
| # | Lag | S | V | O | F | GM-IM | M | P |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  FCRFC Rosengård | 22 | 18 | 3 | 1 | 54-10 | +44 | 57 |
| 2 |  HACBK Häcken FF | 22 | 14 | 5 | 3 | 53-13 | +40 | 47 |
| 3 |  KDFFKristianstads DFF | 22 | 9 | 8 | 5 | 33-26 | +7 | 35 |
| 4 |  ESKEskilstuna United | 22 | 10 | 5 | 7 | 27-22 | +5 | 35 |
| 5 ↑ |  VITVittsjö GIK | 22 | 8 | 8 | 6 | 29-20 | +9 | 32 |
| 6 ↑ |  LFCLinköpings FC | 22 | 8 | 7 | 7 | 33-27 | +6 | 31 |
| 7 ↑ |  HDFFHammarby IF | 22 | 9 | 4 | 9 | 40-37 | +3 | 31 |
| 8 ↓ |  ÖDFFKIF Örebro DFF | 22 | 9 | 3 | 10 | 25-43 | -18 | 30 |
| 9 |  DIFDjurgårdens IF FF | 22 | 6 | 3 | 13 | 21-38 | -17 | 21 |
| 10 |  AIKAIK | 22 | 5 | 5 | 12 | 14-48 | -34 | 20 |
| 11 |  PITPiteå IF | 22 | 4 | 4 | 14 | 19-38 | -19 | 16 |
| 12 |  VXJVäxjö DFF | 22 | 2 | 5 | 15 | 7-33 | -26 | 11 |