Målet kom efter att Saudiarabiens målvakt Mohammed Al-Owais kommit helt fel efter en hörna av Carlos Sanchez. En fristående Suarez kunde peta in bollen vid bortre stolpen.
Målet var Suarez 52:a i landslagströjan och innebar även att han blev historisk som den första uruguayan att göra mål i tre olika VM.
Annars var det ett Saudiarabien som såg bättre ut än i premiären mot Ryssland, speciellt Hattan Bahebri var den som skapade farligheter för saudierna.
I den 26:e minuten skar han in från höger och testade Muslera i Uruguaymålet. Avslutet var saudiernas första på mål i detta VM. Kort därefter fick han chansen igen när han smög sig in mellan Uruguays backar, men återigen missade han avslutet.
Den andra halvleken blev rätt låst och Uruguay kontrollerade matchen. Halvlekens bästa möjlighet fick Carlos Sanchez som fick bollen i straffområdet efter ett fint vänsterinlägg från Cavani, men mittfältarens avslut gick högt över.
Uruguays andra anfallsstjärna, Edinson Cavani, är alltjämt mållös i VM. I slutet av matchen fick PSG-stjärnan ett friläge, men Al-Owais kunde rädda avslutet.
Resultatet innebär därmed att Uruguay och Ryssland är de första lagen klara för åttondelsfinal, medan Egypten och Saudiarabien definitivt får lämna Ryssland.
STARTELVOR
Uruguay: Fernando Muslera; Guillermo Varela, José Maria Gimenez, Diego Godin, Martin Caceres; Carlos Sanchez, Matias Vecino, Rodrigo Bentancur, Cristian Rodríguez; Edinson Cavani, Luis Suárez
Saudiarabien: Mohammed Al-Owais; Mohammed Al-Breik, Osama Hawsawi, Ali Al Bulaihi, Yasser Al-Shahrani; Hattan Sultan Bahebri, Salman Al-Faraj, Abdullah Otayf, Taiseer Al-Jassim, Salem Al-Dawsari; Fahad Al-Muwallad