För två veckor sedan säkrade Gulldén första titeln med norska klubben då man vann den inhemska cupen.
Det följde man upp med att försvara NM-guldet.
Storhamar hade kniven mot strupen efter att ha förlorat det första finalmötet i tisdags. Men trots ett enormt hemmastöd i lördagens andra möte föll laget på nytt.
Matchen slutade 24-17 till Vipers Kristiansand, som därmed tog sin femte raka titel. Gulldén, som flyttar hem till Sverige och Lund (Lugi) inför nästa säsong, stod för två mål i finalen.
I juni väntar Champions Leagues Final4 i Budapest. Vipers möter franska Metz i semifinalen, i en eventuell final väntar antingen Györ eller Esbjerg. Det blir Isabelle Gulldéns sista framträdande i den rosa tröjan.
Även norska stjärnan Nora Mörk lämnar Vipers efter säsongen.
– Det är härligt! Ett fint sätt att avsluta på. Nu ser jag fram emot ett nytt kapitel, säger hon i norska TV2.