Frölunda chockstartade matchen med två mål inom loppet av sex minuter.
Filip Hasa satte 1-0 efter tre minuter innan Filip Johansson tystade hemmapubliken ordentligt med 2-0 strax därefter.
– Det är en tuff start med två mål från ingenstans egentligen. Tyvärr hade vi inte marginalerna med oss i dag, säger Färjestads tränare Thomas Mitell.
I den andra perioden kom Färjestad närmare efter Brandon Davidsons reducering, men det blev hemmalagets enda mål i matchen.
Efter en 3-1-seger är Frölunda vidare till semifinal där seriesegraren Växjö väntar. En av målskyttarna var Erik Borg, som kom till Frölunda under säsongen.
– Det är många hjältar där inne och det var väl inte det snyggaste målet man har gjort. Men alla mål räknas, säger Borg.
26-åringen hyllar matchserien.
– Det har varit helt underbara matcher. Något helt utöver det vanliga.
Färjestads Victor Ejdsell var knäckt efter uttåget.
– Jag tycker vi gör en bra andra period. Vi kanske förtjänar något mer från den. Sista perioden kommer vi inte fram lika mycket som vi hade önskat. Det är små marginaler som avgör i sport, säger han.
SHL
Färjestad BK
1 - 3
Frölunda HC
Semifinalerna i SHL-slutspelet
Spelas i bäst av sju matcher.
Växjö–Frölunda:
31 mars: Växjö–Frölunda
2 april: Frölunda–Växjö
4 april: Växjö–Frölunda
6 april: Frölunda–Växjö
8 april: Växjö–Frölunda (eventuell)
10 april: Frölunda–Växjö (eventuell)
12 april: Växjö–Frölunda (eventuell)
Skellefteå–Örebro:
1 april: Skellefteå–Örebro
3 april: Örebro–Skellefteå
5 april: Skellefteå–Örebro
7 april: Örebro–Skellefteå
9 april: Skellefteå–Örebro (eventuell)
11 april: Örebro–Skellefteå (eventuell)
13 april: Skellefteå–Örebro (eventuell)