Norges storstjärna Kläbo, som gör tävlingscomeback efter Tour de Ski, var 11 hundradelar snabbare än landsmannen Erik Valnes i ett snöigt Otepää.
Teodor Peterson blev bäste svensk med en åttondeplats, knappt fyra sekunder efter norrmannen. Viktor Thorn kom in precis efter på en niondeplats.
Även Johan Häggström gick vidare från kvalet med 24:e bästa tid, medan varken Gustav Nordström, Anton Persson eller Karl-Johan Dyvik klarade topp 30.
Oskar Svensson och Calle Halfvarsson står över helgens tävlingar i Estland för att istället träna på hemmaplan.
RESULTAT KVALET HERRAR, 1,6 KM
1) Johannes Hösflot Kläbo, 3,21,99
2) Erik Valden, +0,11
3) Alexander Bolshunov, +0,53
8) Teodor Peterson, +3,93
9) Viktor Thorn, +4,32
24) Johan Häggström, +83
________________________________
33) Gustav Nordström, +10,68
37) Anton Persson, +11,68
49) Karl-Johan Dyvik, +15,00