Nilsson lämnade i våras posten som ordförande i Svenska Fotbollförbundet men behöll posten som en av flera vice ordförande i det europeiska fotbollsförbundet Uefa. Nilsson är även ordförande i RF, Riksidrottsförbundet, som har en bojkott mot Ryssland.
Uefa har stängt av ryska seniorlag, bland annat fick Ryssland inte delta i kvalet till EM för damer eller kvalet till VM för herrar.
SvFF tydligt emot ryskt deltagande
När Uefa meddelade att Ryssland skulle tillåtas att delta i U17-mästerskapet tidigare i veckan protesterade Sverige.
– Riksidrottsförbundet har ett beslut som säger att inte heller barn- och ungdomsverksamhet från Ryssland får delta i idrottsutövande här i Sverige och vi har dessutom meddelat, och meddelar fortsatt, att vi inte tänker ställa upp mot ryska lag utanför Sverige. Det är vårt besked, sa SvFF:s ordförande Fredrik Reinfeldt under onsdagen.
Bara tre av 20 emot ryskt deltagande
Uefas ändrade hållning ska bero på att barn inte ska straffas för handlingar utförda av vuxna.
I Uefas exekutivkommitté ingår 20 personer och enligt Sky Sports var det bara tre personer som motsatte sig beslutet. Det var britterna David Gill och Laura McAllister samt polacken Zbigniew Boniek.