Vädervarningen gör att arrangörerna stänger en fan-zone och en park där matcher visas på storbildsskärm.
Kraftigt regn med inslag av åska och starka vindar gör att platserna inte hålls öppna av säkerhetsskäl, uppger myndigheter i Dortmund för nyhetsbyrån AP.
Turkiet möter Georgien
Även allmänna platser upplåtna åt EM-aktiviteter i närbelägna städer som Köln, Gelsenkirchen och Düsseldorf stängs under dagen.
I Dortmund uppmanas alla som inte har biljett till kvällens fotbollsmatch att inte ta sig till arenan, fan-zonen eller Friedensplatz där matchen skulle ha visats på storbildsskärm.
Mötet i grupp F mellan Turkiet och Georgien har avspark 18.00.