I den 76:e matchminuten byttes argentinaren, som väntar på att göra sitt första mål för Paris-laget, ut och när Mauricio Pochettino räckte ut handen mot honom såg Messi ut att vika undan och ge tränaren en lång blick på sin väg mot bänken.
– Det här är ett beslut som måste tas av tränaren. När det gäller hans reaktion frågade jag honom hur han tog det, han sa att han var okej. Det var allt. Det var vårt utbyte, säger Pochettino enligt Reuters.
Storklubben Paris SG har överflödets förbannelse med en jättetrupp som rymmer tre lag.
– Jag tror att vi alla vet att vi har fantastiska spelare i den här 35-manna truppen. Endast elva kan spela, vi kan inte spela mer. Besluten i matchen fattas till det bästa för laget och varje spelare, säger Pochettino.
ARKIV: Messi debuterade i PSG:s bortaseger (29 augusti)