Resultatet på långdistansen innebär att Alexandersson bara är 29 poäng före ryskan Natalia Gemperle, som tog hand om tredjeplatsen, inför medeldistansen.
25-åriga Tove Alexandersson leder dock fortfarande världscupen och kan under lördagen säkra sin fjärde raka totalseger.
– Det var en stig som jag inte såg på kartan, så jag tog ett dåligt vägval. Och sedan missade jag själva kontrollen. Jag vet inte hur mycket tid jag tappade där, men det var alldeles för mycket. Efter missen mådde jag inte alls så bra, säger Alexandersson till orienteringsförbundet.
SVT sänder medeldistansen
Martin Regborn, totaltvåa inför säsongsavslutningen, tvingades bryta herrarnas långdistans och har därmed ingen möjlighet att ta hem slutsegern i cupen.
Imorgon sänder SVT den avgörande medeldistansen på svtsport.se och på SVT Play från 12.10.