Tysken tog därmed sin femte Masterstitel.
– US Open börjar om en vecka, så jag vill såklart hålla i det och kanske till och med spela bättre där, säger Zverev och fortsätter:
– Med mitt OS-guld och den här femte Mastern så ser jag verkligen fram emot New York.
Zverev visade inga tecken på den stökiga magen som tvingade honom till en medicinsk timeout i semifinalsegern mot Stefanos Tsitsipas.
Matchen tog slut med en nätboll av rysken Rublev.
– Ända till slutet spelade jag rätt bra tennis. Jag jublade inte stort vid nätet eftersom jag och Andrej varit bästa vänner sedan vi var elva eller tolv, säger Zverev.
På damsidan tog australiskan Ashleigh Barty sin femte titel för säsongen när hon besegrade schweiziska Jil Teichmann i finalen av Cincinnati Masters.
MER TENNIS: Här kraschar Medvedev in i tv-kameran