Han var hela 4.09 efter täten – 4.07 efter sammanlagt som 52:a.
– Det var inte min dag i dag. Det var inga incidenter eller så, jag kände bara att mjölksyran hängde kvar längre i dag. Formen finns nog där ändå så jag ser fram emot fortsättningen, sade Häggström efter loppet.
På nyårsdagen fortsätter herrarnas Tour de Ski med jaktstart över 15 kilometer i klassisk stil.
Calle Halfvarsson har tagit över placeringen som bäste svensk i totalsammandraget, på en tiondeplats.
– Vi får hoppas att det fortsätter att gå uppåt, sade han.
Också från i dag: Halfvarsson: Efter skadan – succélopp av Calle Halfvarsson
Herrställningen i Tour de Ski
Efter tre av sju etapper:
1) Sergej Ustiugov, Ryssland, totaltid: 1.06.43,0.
2) Alexander Bolsjunov, Ryssland, +27,0 sekunder.
3) Johannes Høsflot Klæbo, Norge, +37,0.
Bäste svensk:
10) Calle Halfvarsson, +1.34,0.