Den 25-åriga schweiziskan har tagit två pallplatser i störtlopp den här säsongen men tvingas nu till en operation.
– Det gör såklart väldigt ont att behöva avsluta säsongen i förtid. Jag är också medveten om att jag inte haft någon allvarlig skada de senaste åtta åren. Därför är det inte allt för svårt att acceptera den här skadan och se möjligheten i att få lite vila, säger hon.
Gisin har vunnit såväl OS-guld (2018) och VM-silver (2017) i kombination. Hon ligger nia i den totala världscupen och sexa i störtloppscupen.
Även österrikiska guldhoppet Cornelia Hütter missar VM efter en våldsam krasch i helgen. Österrikiskan skadade ledbandet i höger knä och är borta i 4-6 veckor.