Hagström var sjuk över jul och nyår, men har laddat rejält för sprinten i Falun.
– Jag var lite seg på uppvärmningen, men jag har laddat länge för det här, säger hon.
Tvåa blev Anna Dyvik och trea var Sophie Caldwell före Jonna Sundling och Emma Ribom. Övriga svenskor som tog sig vidare från kvalet var Linn Svahn, Linn Sömskar, Maja Dahlqvist och Moa Lundgren.
Charlotte Kalla, Ebba Andersson och Frida Karlsson står över sprinten och fokuserar på söndagens tävling.
Halfvarsson övertygade i succéfyllt svenskt kval
I herrkvalet övertygade Calle Halfvarsson och var sexa, 2,22 efter den vinnande norrmannen Erik Valnes. Johan Häggström (8), Oskar Svensson (16), Viktor Thorn (16 i världscupdebuten), Teodor Peterson (20), Marcus Grate (26), Martin Bergström (28) och Anton Persson (30) gick också till kvartsfinal. Alltså åtta svenska herrar till kvartsfinal.
Thorn inför comeback-helgen