Blockaden, som ska träda i kraft den 27 januari, sker enligt förbundet som sympatiåtgärd med den palestinska fackföreningsrörelsen, på grund av kriget i Gaza.
Exakt vilket gods som ska omfattas är ännu oklart, men enligt ordföranden Martin Berg kommer förbundet att tillämpa en försiktighetsprincip.
"Det innebär inte särskild hänsyn till ekonomiska intressen för svenska företag och offentliga institutioner utan att vi vid tveksamhet om varor på väg till eller från Israel är av civil eller militär karaktär, kommer att vägra att lasta eller lossa dem", säger han i ett pressmeddelande.