Rådström Baastad säger att det är svårt att kombinera riksdagsarbetet med rollen som partisekreterare.
– För mig är det svårt att både vara på plats i Stockholm och resa i landet. Det går inte ihop, säger hon till P4.
Hon fattade beslutet redan innan sommaren, men regeringskrisen sköt upp beskedet.
Eva-Lena Jansson (S) ska ersätta Rådström Baastad i riksdagen.
När partiet nu ska välja ny ordförande efter Stefan Löfven meddelar också Lena Rådström Baastad att hon står till förfogande för den nye partiledaren.