SMHI skriver i sin varning att marken i området är mättad efter tidigare regn och att måndagens regnfall nu kan innebära att vattendrag och åar kring sjön kan svämma över.
De höga vattenflödena kan påverka byggnader, vägar och viadukter. Strömhastigheterna i vattendragen blir också högre.
Varningen utfärdades vid lunchtid på måndagen och gäller tillsvidare.
Vättern töms på vatten
Under den gångna helgen steg Vätterns vattenstånd med sex centimeter och nu ökas flödet i Motala Ström för att sänka nivåerna i sjön.
Det är Tekniska verken i Linköping som genomför sänkningen då sjön ligger 40 centimeter över medelnivån som den brukar ha sommartid. Men på Tekniska verket menar man att det kan ta tid innan effekten visar sig.
– Vi har haft högre flöden och högre nivåer än normalt hela det senaste året, säger Marcus Bennstam, energistrateg på Tekniska verken, till SVT Nyheter Jönköping.
