Problemen har varit återkommande under några veckor och har enligt Trafikverket samband med att järnvägen rustas upp.
Tidigare har det flera gånger handlat om kablar som grävts av mellan Linköping och Norrköping, vilket lett till signalfel.
På tisdagsmorgonen meddelade Trafikverket att det senaste felet berodde på växlarna, och felet åtgärdades till klockan 10.
De sträckor som påverkas är Stockholm C – Linköping/Nässjö/Malmö, Sala – Linköping samt Östgötapendeln Norrköping – Tranås/Motala.
Stationer där tågtrafiken kan påverkas
Kimstad, Motala C, Skänninge, Mjölby, Mantorp, Vikingstad, Linköping C, Linghem, Norrköping C, Boxholm, Tranås, Stockholm C, Nässjö C, Alvesta, Älmhult, Hässleholm, Lund C, Malmö C
Källa: Trafikverket