23-åringen är från Malmöområdet och har varit internationellt efterlyst sedan veckan efter sprängningen i början av augusti.
En annan man, en 22-åring från Skåne, hade då redan gripits i Sverige. Han häktades av Malmö tingsrätt och överlämnades därefter till Danmark.
Nu är alltså båda männen gripna. Vid lunchtid på onsdagen häktades 23-åringen av Köpenhamns byret. Han kommer att vara frihetsberövad fram till den 24 september.
23-åringen kom till rätten iförd joggingdress, skriver Danmarks Radio på sin nyhetssajt. En svensk tolk översatte vid förhandlingen, som hölls bakom stängda dörrar.
Fönster krossades
– Det här är en mycket allvarlig fråga och vi inledde därför omedelbart en omfattande utredning. Nu är båda männen frihetsberövade och vi ser fram emot att kunna gå vidare i utredningen, säger polisinspektör Brian Belling i ett pressmeddelande.
Det var kvällen den 6 augusti som Skattestyrelsen i området Österbro i Köpenhamn skakades av en explosion. Laddningen var placerad precis utanför huvudingången. Inga personer kom till skada men flera rutor krossades.