Pappan har med avsikt och på ett särskilt hänsynslöst sätt dödat de två barnen och det finns inga förmildrande omständigheter, skriver tingsrätten i domen.
Efter avtjänat livstidsstraff ska mannen utvisas från Sverige och förbjudas att återvända.
Dödades hemma i radhuset
Det var på kvällen den 23 april som Södertälje och Sverige skakades av nyheten att två barn hittats döda i sitt hem.
Initialt greps båda föräldrarna men snart erkände pappan att han dödat barnen och mamman friades från alla misstankar.
Syskonparet beskrivs av anhöriga SVT talat med som varma och hänsynsfulla personer.
Den åttaårige pojken hade just fått ett akvarium han tyckte om att stå vid, och för polisen har en lärare berättat att den sjuåriga lillasystern varit blyg men just börjat skratta i leken med klasskamraterna.
Ingen psykisk störning
I domen tecknas en bild av en tilltagande depression hos pappan kopplad till identitetsproblematik, och han uppger själv att han försökt ta sitt liv flera gånger.
Men enligt ett utlåtande ska pappan inte ha lidit av någon allvarlig psykisk störning vid tiden för morden och han var inte heller påverkad av någon substans.
Mannen erkände tidigt att han kvävt pojken och flickan till döds med gasen helium, men har genom sin försvarare hävdat att morden inte var planerade och av personliga skäl motsatt sig utvisning.
Åklagaren lade i rätten fram bevis från bland annat telefoner, datorer, kvitton, obduktionsprotokoll och i form av föremål från brottsplatsen.
Pappans advokat har inga kommentarer till huruvida domen kommer att överklagas, vilket kan ske inom tre veckor.
I videon ovan: Mammans advokat berättar mer om hur hon reagerade på domen.
Här finns hjälp & Stöd att få
Kontakta en psykiatrisk akutmottagning eller ring 112 om du mår så dåligt att det känns outhärdligt, eller om du har självmordstankar eller självmordsplaner.
Nedan hittar du kontaktvägar till andra organisationer för stöd och hjälp.